Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gkn2Q9CQS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gkn2Q9CQS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms