Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim8Q9CQQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim8Q9CQQ0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms