Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rab5aQ9CQD1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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