Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubl4bQ9CQ84 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ubl4bQ9CQ84 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ubl4bQ9CQ84 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms