Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms