Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Use1Q9CQ56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms