Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4921530L21RikQ9CQ47 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms