Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp3Q9CQ10 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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