Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms