Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim3Q99PE5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim3Q99PE5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim3Q99PE5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms