Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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