Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ubqln4Q99NB8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubqln4Q99NB8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ubqln4Q99NB8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln4Q99NB8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubqln4Q99NB8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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