Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl3Q99N95 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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