Protein–RNA interactions for Protein: Q99MZ7

Pecr, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PecrQ99MZ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PecrQ99MZ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PecrQ99MZ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms