Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp26Q99MX1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp26Q99MX1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms