Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nkd1Q99MH6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms