Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gins4Q99LZ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms