Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnpo2Q99LG2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms