Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TriobpQ99KW3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TriobpQ99KW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms