Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf34Q99KR6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf34Q99KR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms