Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clint1Q99KN9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms