Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dok4Q99KE3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dok4Q99KE3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms