Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Me2Q99KE1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Me2Q99KE1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms