Protein–RNA interactions for Protein: Q99K99

Uncharacterized protein C4orf19 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99K99 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q99K99 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q99K99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q99K99 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q99K99 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q99K99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q99K99 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99K99 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99K99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99K99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q99K99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms