Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms