Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krcc1Q99JT5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms