Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GatbQ99JT1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms