Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pacsin3Q99JB8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms