Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd1Q99J36 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thumpd1Q99J36 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms