Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim11aQ99J19 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim11aQ99J19 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms