Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf112Q96DY5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms