Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SptssbQ925E8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms