Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Letmd1Q924L1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms