Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd1Q923L3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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