Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim59Q922Y2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim59Q922Y2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms