Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sf3b3Q921M3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sf3b3Q921M3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms