Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp4Q921I6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Sh3bp4Q921I6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp4Q921I6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms