Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi2Q920Q6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi2Q920Q6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms