Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pde6cQ91ZQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde6cQ91ZQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms