Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc49Q91YK0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc49Q91YK0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms