Protein–RNA interactions for Protein: Q91WW7

Pnpla3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla3Q91WW7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pnpla3Q91WW7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pnpla3Q91WW7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms