Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csde1Q91W50 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Csde1Q91W50 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms