Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp3Q91W36 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms