Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NifkQ91VE6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms