Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp4Q8VHC5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cabp4Q8VHC5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cabp4Q8VHC5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms