Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms