Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VCE4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VCE4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms