Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Med17Q8VCD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms