Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef3Q8VCC8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms