Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApobrQ8VBT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApobrQ8VBT6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms